Acpype安装

在使用AmberTools工具生成Gromacs的top文件时候，需要调用acpype转换。下面介绍其安装方法。

1、 下载acpype，在github上下载到本地，如下链接。

https://github.com/t-/acpype

2、 解压之后上传到linux系统自己目录里。

3、 进入这个目录之后，为acpype.py添加可执行权限。

chmod  +x  acpype.py

4、 使用下面命令打开bashrc文件，添加环境变量。

vi   ~/.bashrc

添加的内容为：

export  PATH=/yourpath/acpype-master:$PATH

上诉，yourpath为你acpype-master所在路径。

5、 关闭终端，重新进入，输入 acpype.py 看是否成功。

6、 有些脚本使用的是acpype，不带py后缀，其实是一样的。把脚本中acpype修改成acpype.py即可。或者使用超级管理员权限运行下面命令（可不再添加环境变量）：

ln   -s   /yourpath/acpype-master/acpype.py   /usr/local/bin/acpype

即可使用acpype，而不是acpype.py，效果一样的。