基于粘塑性自恰模型（VPSC）的钛合金拉伸压缩织构演变模拟

关键词：pKa,高精度热力学计算，DFT，Gaussian，量子化学胺类化合物在化学、药物化学和生物化学中扮演着重要角色，它们不仅广泛应用于药物设计、催化反应、环境污染治理等领域，而且其酸碱性质直接影响分子的溶解度、生物利用度和代谢途径。因此，准确预测胺类分子的 pKa 值，对于理解其酸碱行为和调控其化学反应性具有重要意义。pKa 值反映了分子在水溶液中的酸性或碱性强度，通常通过实验测定，但实验方法常常受到溶剂效应、温度、离子强度等因素的影响，且对于复杂分子的测定具有较大的挑战。因此，基于量子化学计算的理论预测成为了近年来研究的热点之一，尤其是高精度计算方法如Gaussian软件的应用，提供了一种可靠的理论工具。胺类分子通常包含氮原子，并具有一个或多个可接受氢离子的氨基团。胺类分子的酸碱性质通常表现为其在水溶液中与氢离子（H⁺）的结合或解离过程，即酸碱平衡反应。例如，一级胺（RNH₂）在水中与氢离子反应形成铵离子（RNH₃⁺）。在该过程中，胺类分子通过质子化作用（氢离子结合）表现出碱性。胺类分子的 pKa 值定义为其氨基团解离（或接受氢离子）的酸碱平衡常数。胺类分子的 pKa 值受到多种因素的影响，包括分子的结构（如取代基、环结构、电子效应等）、溶剂的极性、温度和分子的构象变化等。通常，胺类化合物的 pKa 值范围从 9 到 12 左右，但这一范围会因分子内部的电子效应、氢键作用等因素而有所变化。准确预测这些值不仅有助于理解胺类分子的酸碱性，还能帮助设计更具生物活性的分子或优化分子在水相中的稳定性。Gaussian 软件是目前最广泛使用的量子化学计算工具之一，它能够通过各种量子化学方法模拟分子的结构、性质以及反应机理。在计算 pKa 值时，Gaussian 软件通过密度泛函理论（DFT）、Hartree-Fock (HF) 方法、多体扰动理论（MP2）以及更高精度的配置交互（CCSD）等方法进行分子结构优化和能量计算。这些方法能够提供准确的电子结构信息，为计算 pKa 值提供理论支持。使用量子化学方法精确计算胺类小分子的 pKa 值时，存在一些技术和理论上的难点。以下是主要的一些挑战：溶剂效应的考虑胺类分子的 pKa 值是溶液中的酸碱平衡常数，因此溶剂效应对 pKa 值的影响非常大。量子化学方法通常是在气相中进行的，而在气相中的计算无法直接反映溶剂效应。因此，需要引入溶剂化模型（如极性溶剂模型、PCM、SMD 等）来估算溶剂效应，但这些模型往往只能近似溶剂环境，而无法完全精确地模拟真实溶剂对酸碱反应的影响。氢离子的处理pKa 值的计算本质上是计算氢离子的解离过程。量子化学计算通常要求对氢离子的行为进行精确模拟，尤其是在有机分子中，氢离子的解离常常涉及复杂的相互作用，如氢键、分子间力等。对这些现象的精确建模仍然具有挑战性。构象依赖性胺类分子的结构可能会影响其酸碱性质。不同的构象可能导致氢离子的解离能量有所不同，因此需要对分子的多种构象进行计算，并找到最低能量构象。然而，在大分子或复杂溶剂环境中，构象的优化和筛选也非常复杂且计算量大。电子相关效应胺类分子的酸碱行为涉及到电子的重新分布和共振效应。量子化学计算中的电子相关效应（如电子交换-关联能量）对精确预测 pKa 值至关重要，但这些效应需要高精度的波函数方法来处理，如多体效应（多体波函数方法）或高阶的密度泛函方法。高精度的计算通常需要较大的计算资源，特别是在计算分子的多体电子效应时。计算精度和方法的选择用于量子化学计算的方法（如 DFT、HF、MP2、CCSD 等）各有优缺点。选择合适的计算方法和基组对于得到准确的 pKa 值非常重要。较低级别的方法可能无法捕捉到复杂的电子结构效应，而高精度方法可能会导致计算成本过高，因此需要平衡精度和计算效率。酸碱反应的平衡计算 pKa 值要求对酸碱平衡进行全面分析，通常涉及到化学反应的自由能变化，这不仅仅是计算单一反应物和产物的能量差异，还要考虑过渡态的能量和解离过程中的所有中间态。在许多情况下，反应路径的选择和过渡态的确定也增加了计算的复杂度。本案例设计DAP-2H电离的热力学循环，辅助高精度完备基(Complete Basis Set, CBS)方法CBS-QB3计算了DAP-2H分子的酸碱性pKa。计算结果符合实验预期，这得益于我们选用了更昂贵的高精度热力学计算方法。图1 2,3-二氨基吩嗪(DAP) 和DAP2H优化后的结构以及的氧化还原反应DAP-2H的pKa计算在如表1所示的计算级别下，分别计算各个分子/离子的吉布斯自由能。根据图2 所述热力学循环,计算DAP-2H的酸碱性pKa。表1 DAP-2H的pKa计算泛函/基组/溶剂模型分子/离子种类泛函/基组溶剂模型DAP-2H(gas)CBS-QB3DAP-H-(gas)CBS-QB3DAP-2H(gas)M052X/6-31G*DAP-H-(gas)M052X/6-31G*DAP-2H(sol)M052X/6-31G*SMD(隐式溶剂)DAP-H-(sol)M052X/6-31G*SMD(隐式溶剂)图2 pKa计算的热力学循环DAP-2H的pKa计算分析根据图所述热力学循环[54],可得pKa的计算公式如下：ΔGsolno=ΔGgaso+ΔGsolv(H+)+ΔGsolv(A-)-ΔGsolv(HA)(1)pKa=ΔG*soln/RTln(10)(2)ΔG*soln=ΔGsolno+1.89Δn(3)此计算方法计算pKa时，Ggas(H+)与ΔGsolv(H+)采用了实验值，由下面公式(4)直接计算pKa:pKa=[Ggas(A-)-Ggas(HA)+ΔGsolv(A-)-ΔGsolv(HA)-269.0]/1.3644 (4)Ka(5,10-Dihydrophenazine-2,3-diamine)Ggas(DAP-2H)-682.376788HareteeGgas(DAP-H-)-681.814079HareteeGsolv(DAP-2H)-0.026523949Kcal/molGsolv(DAP-H-)-0.106513784Kcal/molGgas(H+)-6.28Kcal/molGsolv(H+)-264.61Kcal/molΔG*soln32.62Kcal/molpKa23.91表2 DAP-2H的pKa如表 2 所示，计算得到DAP-2H的pKa为23.91，远大于水的pKa(15.6),证明在水性溶剂环境下，DAP与水分子反应得到DAP-2H分子而稳定存在。来源：320科技工作室