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GROMACS分子模拟专题四:非标准残基力场构建和高分子itp构建
GROMACS的pdb2gmx程序可以根据输入的坐标文件产生拓扑文件,但是如果体系中有其不能识别的残基名字,那么就会报错,不能生成itp文件。这种情况...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥299
5.0
GROMACS分子模拟专题三:质心牵引(伞形采样)模拟仿真计算
1、计算结合自由能结合能(ΔGbind)可由一系列伞形采样模拟得到的平均力势(PMF, potential of mean force)导出. 在这个过程中会创建一系列初始...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥299
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-2:快速生成高分子ITP以及模拟
教你快速建立高分子ITP以及模拟仿真
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥9
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真基础之创建索引(选择任意基团或原子)
本次课程为大家讲解在GROMACS里面如何创建任意基团或者原子的索引文件,以至于我们可以使用该索引文件进行任意的数据分析。
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥299
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真基础之补全蛋白缺失氨基酸或原子
做蛋白模拟之前,必须对目标蛋白的pdb进行检查。主要是看是否缺失了氨基酸残基或者缺失了氨基酸上面的原子。如果有缺失,那么在模拟之前需要进...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥199
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-8:分析命令之盐桥的分析
通过计算蛋白质之间的盐桥,可以了解蛋白质的稳定性。如何使用gromacs分析盐桥以及注意事项
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥19
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-3:分析命令之氢键相关性质
GROMACS分析命令之氢键相关性质讲解
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥19
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-6:分析命令之径向分布函数函数和配位数
GROMACS分析命令之径向分布函数函数和配位数讲解
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥19
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-10:分析命令之计算溶剂可及面积
GROMACS分析命令之计算溶剂可及面积讲解
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥19
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-9:分析命令之计算空间分布函数SDF
GROMACS分析命令之计算空间分布函数SDF讲解
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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