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GROMACS中MDP模板以及关键字讲解
一般来说,gromacs所用到的参数控制文件(mdp)基本上是大同小异的。仅需进行一些小小的更改即可。或者按照自己的体系进行微调。下面给大家提...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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GROMACS各种文件格式介绍
CPT文件:该文件为模拟断点文件(checkpoint,.cpt)。该文件为模拟过程固定时间间隔产生,保存模拟系统所有信息。该文件一部分可以在能量文件...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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Gromacs联用GAFF力场处理水溶剂下小分子动力学
与GROMACS偏重生物大分子模拟的力场不同,AMBER支持很多方便处理有机小分子的力场,如GAFF力场,简单而又有不错的精度,适合处理有机小分子;...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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Gromacs结合自由能计算教程(三)
以下文章来源于网络,如有侵权,请联系管理员删除!一、准备拓扑文件对于一个有一定经验的分子模拟工作者而言,应该知道如何准备拓扑文件。如果...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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结合能计算工具使用方法
1.gmx_MMPBSA介绍2021年发展的gmx_MMPBSA工具令GROMACS用户可以直接利用免费的AmberTools的MMPBSA.py进行结合自由能计算。该程序支持高版本的...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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Particleworks和RecurDyn联合仿真案例-发动机润滑
通过查看RecurDyn仿真发动机的固体运动,通过Particleworks仿真液体润滑分布。一、生成RecurDyn模型1.RecurDyn运行。点击Browse选.Workshop6中...
CFD饭圈
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20+款CFD流体仿真计算平台大观:全球主流产品解读及其行业应用
在当今高科技产业中,计算流体动力学(ComputationalFluidDynamics,CFD)已成为解决复杂流动问题的利器。本文将带领您深入探索超过20个世界领...
CFD饭圈
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CFD模拟背后的22大核心理论技术
在科技与工程领域,计算流体动力学(CFD)以其强大的预测和分析能力,在航空航天、能源、汽车制造、生物医学等诸多行业中发挥着举足轻重的作用...
CFD饭圈
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见多了宏观流体仿真,来了解下微流体CFD仿真吧
在微观尺度下,流体展现出迥异于宏观世界的奇特行为。微流体技术,这一在微观管道与通道中操纵流体的前沿领域,正以前所未有的精确度推动着生...
CFD饭圈
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热量Heat是什么:从11个维度讨论
热量是从一个温度较高的物体转移到一个温度较低的物体的热能。温度是粒子平均动能的量度。1.热量的定义热量是因温度差异而在系统或物体之间传...
CFD饭圈
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