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分子动力学
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分子动力学模拟的时间尺度:从简单LJ势开始
(注:本文章来源于网络,如有侵权,请联系我们删除。)来源:模拟之家
刘十三613
分子动力学、GROMACS
706
GROMACS里限制、冻结等参数的用法
在使用gromacs进行分子动力学模拟时候,我们常需要把某个原子、基团或者分子保持在固定位置,另一方面需要把分子中的某个键长、键角或者二面角...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1838
不同PH下蛋白和小分子的模拟
GROMACS专题十一:不同PH下蛋白和小分子的模拟GROMACS专题十一:不同PH下蛋白和小分子的模拟由于实际实验环境可能会涉及不同PH下的模拟,而目...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1184
自由能形貌绘制
1.自由能形貌图(freeenergylandscape,FEL)自由能形貌图,就是用一张图来表示分子的构象自由能的变化。比如文献中常见的这类图:图上不同的能...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
510
所有原子的LJ参数
在做分子动力学模拟的时候,对于元素周期表靠后的一些原子,GROMACS和大部分生成ITP文件的软件或方法均不能支持。需要用户手动去设置一些参数...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1117
基于伏图的数字心脏模拟仿真APP应用介绍
一、背景介绍心脏是保证人体正常运转最重要的动力,人体内的血液循环通过心血管运输到各个部位,因此,心血管系统的稳定是人体健康的关键。心...
仿真APP
仿真APP,赋能每一个工业品。
3302
生物医学工程仿真案例研讨会第二期(北京) 邀请函
大赛通知
仿真秀平台赛事运营官方账号
3492
基于Gromacs的蛋白质与小分子配体相互作用模拟教程
在生命科学的广阔领域中,蛋白质与小分子配体之间的相互作用扮演着至关重要的角色。这些相互作用不仅影响着生物体内的各种生命活动,如信号传...
320科技工作室
lammps/ms/vasp/
3313
纳米力学(nanomechanics)最新进展
点击上方蓝字了解更多计算与STEM领域研究前沿文一:矿物粗糙度通过联锁和摩擦状滑动强化珍珠层摘要:虽然人们普遍认为矿物薄片的表面粗糙度在...
江野
等春风得意,等时间嘉许。
3982
超快动力学计算(二):误差来源与相应的对策
在上期内容中(点击链接跳转🔗),我们介绍了超快动力学的一些基本概念和理论方法的分类。由于本系列主要是针对凝聚态材料计算,考虑到计算...
龙讯旷腾
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