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GROMACS分子模拟专题十一:不同PH下蛋白和小分子的模拟仿真
本视频课程主要讲解:GROMACS不同PH下蛋白和小分子的模拟仿真。为付费用户提供VIP交流群和知识圈答疑,欢迎订阅用户联系仿真秀官方客服加入VI...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥259
5.0
GROMACS分子模拟专题十:胶原纤维构建
本视频课程主要讲解:如何搭建胶原纤维结构文件以及如何生成GROMACS所需的ITP文件。为付费用户提供VIP交流群和知识圈答疑,欢迎订阅用户联系仿...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥299
5.0
GROMACS分子模拟专题九:多糖-纤维素结构建立
本次专题讲解如何搭建多糖、纤维素等结构文件以及如何生成GROMACS所需的ITP文件。1. 多糖结构、力场文件的生成——glycam力场为例2. 多糖结...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥359
5.0
GROMACS分子模拟专题八:二氧化硅-石墨烯-氧化石墨烯等周期性体系的构建方法
本专题视频主要讲解:对于周期性很强的一些有机分子、无机矿物等的模拟,其分子的itp文件是不易从已有工具获得的。可以使用GROMACS自带的功能...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥359
5.0
GROMACS分子模拟专题七:虚拟墙(基底)的实现
本次专题视频教程为大家讲解GROMACS中虚拟墙的搭建。虚拟墙可用于设置基底,模拟体系在某个基底上的排列等。还可以用于界面、流动体系,使其不...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥120
4.0
GROMACS分子模拟专题六:TOP-ITP文件介绍
由于许多初学者遇到的错误多是由于对ITP、TOP等文件不了解所致,所以本课程详细讲解了GROMACS模拟所需文件ITP、TOP的格式内容。学习之后,可对...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥120
5.0
GROMACS分子模拟专题五:粗粒化力场建立和模拟仿真
粗粒化分子动力学(Coarse Grained Molecular Dynamics, CGMD)方法是近几年来发展起来的一种可以在介观尺度上描述分子体系演变过程的计算机模拟...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥359
5.0
GROMACS分子模拟专题四:非标准残基力场构建和高分子itp构建
GROMACS的pdb2gmx程序可以根据输入的坐标文件产生拓扑文件,但是如果体系中有其不能识别的残基名字,那么就会报错,不能生成itp文件。这种情况...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥299
5.0
GROMACS分子模拟专题三:质心牵引(伞形采样)模拟仿真计算
1、计算结合自由能结合能(ΔGbind)可由一系列伞形采样模拟得到的平均力势(PMF, potential of mean force)导出. 在这个过程中会创建一系列初始...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥299
5.0
分子动力学GROMACS模拟仿真-2:快速生成高分子ITP以及模拟
教你快速建立高分子ITP以及模拟仿真
刘十三613
分子动力学、GROMACS
¥9
5.0
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