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非键参数非键参数包括vanderWaals参数V(c6或σ,由组合规则决定)和W(c12或ϵ),它们列在ffnonbonded.itp文件中,其中的ptype是粒子类型[*type]指...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1015
Gromacs基于OPLS-AA力场的聚合物建模及模拟
本文内容包括：1.OPLS-AA力场简介/高分子模拟常用力场；2.聚合物建模方法；3.Gromacs添加非标准残基建模聚合物的方法；4.聚合物PDB文件生成；...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1453
linux版本vmd安装方法
做计算模拟，免不了要用到vmd这款非常强大的工具，为了避免在win和linux两个系统之间来回切换，可以直接安装linux版本的vmd，在命令窗口直接运...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
3548
生成小分子力场TOP（ITP）文件(四)：生成charmm力场
Charmm力场介绍和安装Charmm力场由哈佛大学MartinKarplus教授（MartinKarplus教授2013年诺贝尔化学奖得主）所建立发展的。此力场可应用于研究...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2530
关于范德华力的一些知识
范德华力的定义是十分模糊的，以至于不同领域给出的答案可能有很大出入，我们国内教材上所说的范德华力大致都是这么说的：“范德华力是一种分...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2518
Ambertool和acpype安装和使用
AmberTools对于GROMACS用户来说，主要是使用其生成小分子的itp文件。这里为大家介绍一下AmberTool、acpype简单快速的安装方法和使用方法。不需...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2544
结合能计算工具使用方法
1.gmx_MMPBSA介绍2021年发展的gmx_MMPBSA工具令GROMACS用户可以直接利用免费的AmberTools的MMPBSA.py进行结合自由能计算。该程序支持高版本的...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2233
DeepChem教程-1.3：MoleculeNet
MoleculeNet简介DeepChem最强大的功能之一是它带有“包含电池”的数据集供使用。DeepChem开发者社区维护着MoleculeNet[1]数据集套件，该套件维...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2605
天线理论基础--基于拓扑和材料的小型化技术分类介绍
天线小型化一直是天线研究的主题。然而，天线尺寸的减小会导致其带宽和效率的降低。天线的小型化技术是指在不显著影响天线性能的前提下，通过...
周末--电磁仿真
微波电磁波
2844
影响纤维增强聚合物基复合材料疲劳行为的因素
《FactorsAffectingtheFatigueBehaviorofFiber‑ReinforcedPolymerMatrixComposites》作者为C.HemanthKumar、ArunkumarBongale和C.S.Venkates...
气瓶设计的小攻城狮
从事IV储氢气瓶行业。
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