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CFD丨多相流案例丨01VOF：重力驱动流体
本案例为STAR-CCM+帮助文档案例学习，只是笔记记录！在STAR-CCM+中设置重力驱动流体。模拟通过连接两个腔室的通道的二维重力驱动的可压缩流体...
Shmily89
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2511
CFD丨多相流案例丨04VOF：沸腾
本案例为STAR-CCM+帮助文档案例学习，只是笔记记录！使用的网格同CFD丨多相流案例丨01VOF：重力驱动流体只是此例中的相关物理维度均缩小了，以...
Shmily89
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3087
CFD丨多相流案例丨03VOF：空化
本案例为STAR-CCM+帮助文档案例学习，只是笔记记录！使用的网格同CFD丨多相流案例丨01VOF：重力驱动流体只是此例中的相关物理维度均缩小1000倍...
Shmily89
签名征集中
2716
氢键的小秘密和GROMACS计算氢键的原理
1、当氢与F、O、N形成共价键时，键结电子被吸引偏向F、O、N原子而带部分负电荷，此时氢形成近似氢离子(H+)的状态，能吸引邻近电负性较大的F、...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1551
Gromacs必备Linux基础命令
cd功能说明：切换目录语法：cd<name>cd/path/name/cd/转换到根目录cd~转换到家目录（即/home/name/）cd../转换到上一级目录cd-转换到上...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
2216
PDB文件格式说明
以下文章来源于MolSimu，作者JerkwinPDB(ProteinDataBank)是一种标准文件格式,其中包含原子的坐标等信息,提交给ProteinDataBankattheResearch...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1967
TOP文件解读
非键参数非键参数包括vanderWaals参数V(c6或σ,由组合规则决定)和W(c12或ϵ),它们列在ffnonbonded.itp文件中,其中的ptype是粒子类型[*type]指...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
514
Packmol的使用-构建分子动力学初始结构
以下文章来源于网络，若有侵权联系删除。Packmol简介Packmol是一个免费的、很有价值的构建分子动力学模拟初始结构的工具，非常流行。简单来说...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
841
GROMACS分析命令（二）：do_dssp计算蛋白二级结构
GROMACS程序调用第三方软件DSSP，从轨迹文件中读出蛋白质的二级结构信息。要使用该程序，必先安装好DSSP软件。安装DSSP完毕后(/home/user/sof...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
399
VMD使用教程（三）
VMD中的原子选择方法VMD提供了非常丰富的原子选择方法，可以实现非常复杂的原子选择问题。但语法上基本上是keyword+逻辑运算+通配符+数学表达...
刘十三613
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