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行家
linux版本vmd安装方法
做计算模拟,免不了要用到vmd这款非常强大的工具,为了避免在win和linux两个系统之间来回切换,可以直接安装linux版本的vmd,在命令窗口直接运...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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生成小分子力场TOP(ITP)文件(四):生成charmm力场
Charmm力场介绍和安装Charmm力场由哈佛大学MartinKarplus教授(MartinKarplus教授2013年诺贝尔化学奖得主)所建立发展的。此力场可应用于研究...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
717
一种适用于无机体系、金属体系、界面的力场
目前,对于GROMACS能用的力场来说基本上都是属于有机体系。虽然也发展了一些无机金属等原子的参数,但是模拟效果往往不乐观。Heinz团队开发出...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1077
如何计算蛋白长宽高
1、shell进行读取代码如下:#!/bin/sh#x轴grep^ATOM$1|awk‘{print$7}’|sort-n|sed-n‘1p;$p’#y轴grep^ATOM$1|awk‘{print$8}’|sort-n|sed-...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
275
结合能计算工具使用方法
1.gmx_MMPBSA介绍2021年发展的gmx_MMPBSA工具令GROMACS用户可以直接利用免费的AmberTools的MMPBSA.py进行结合自由能计算。该程序支持高版本的...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
1233
DeepChem教程-1.1:DeePChem介绍
深度生命科学的基本工具欢迎来到DeepChem的深度生命科学入门教程。本系列笔记本是一个循序渐进的指南,可帮助您了解为生命科学进行深度学习所...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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DeepChem教程-1.2:使用数据集
使用数据集数据是机器学习的核心。本教程介绍DeepChem用于存储和管理数据的“Dataset”类,它为处理大量数据提供了简单且功能强大的功能,它支...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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CFD大牛养成之路:必备技能、经典书籍与进阶攻略
在工程计算和流体动力学领域,CFD(ComputationalFluidDynamics)已成为一项不可或缺的关键技术。那么,如何从初学者逐步成长为CFD领域的“大...
CFD饭圈
分享CFD文章,感谢关注
747
如何成为一名优秀的CFDer工程师大神
嘿,伙计们,在这个科技飞速发展的时代,有一种神秘角色正在幕后推动着工业设计的革新,他们就是我们今天的主角——计算流体动力学(CFD)工程...
CFD饭圈
分享CFD文章,感谢关注
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【教程】6-ParaView如何采用并行方式高速可视化大规模数据
1.并行可视化可视化软件ParaView的并行可视化是通过客户端-服务器方式实现的。这种方式适合于想要高速可视化大规模数据的情况。2.客户端-服务...
CFD饭圈
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