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热设计丨热阻(三)
本文根据王永康《ANSYSIcepak进阶应用导航案例》第五章案例操作学习笔记整理。PS:热阻系列还有一篇,就完结!1JESD51-2A测试标准首先,看一下...
Shmily89
签名征集中
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热设计丨热阻(四)
本文是热阻系列最后一篇,主要是接触热阻相关内容,软件中接触热阻设置方法,以及影响接触热阻因素。1Workbench接触热阻设置方法在热分析丨热...
Shmily89
签名征集中
1135
氢键的小秘密和GROMACS计算氢键的原理
1、当氢与F、O、N形成共价键时,键结电子被吸引偏向F、O、N原子而带部分负电荷,此时氢形成近似氢离子(H+)的状态,能吸引邻近电负性较大的F、...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
388
PDB文件格式说明
以下文章来源于MolSimu,作者JerkwinPDB(ProteinDataBank)是一种标准文件格式,其中包含原子的坐标等信息,提交给ProteinDataBankattheResearch...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
431
GROMACS如何使用其他水模型
进行分子动力学模拟,水分子十分重要,除非选择使用连续介质模型(implictitwatermodel)。水分子模型较多,选择这些模型要结合使用的力场,并...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
541
Gromacs联用GAFF力场处理水溶剂下小分子动力学
与GROMACS偏重生物大分子模拟的力场不同,AMBER支持很多方便处理有机小分子的力场,如GAFF力场,简单而又有不错的精度,适合处理有机小分子;...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
309
Gromacs结合自由能计算教程(二)
以下文章来源于网络,如有侵权,请联系管理员删除!如何计算自由能?续上回讲到的,上一章简要介绍了自由能计算的相关背景与炼金术热力学途径。...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
171
DeepView使用
DeepView(曾经叫做Swiss-PdbViewer),也叫DV或SPV,是一种界面友好,基于计算机应用,功能强大的三维图形软件工具。它是由瑞士日内瓦分子生物服...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
114
一种适用于无机体系、金属体系、界面的力场
目前,对于GROMACS能用的力场来说基本上都是属于有机体系。虽然也发展了一些无机金属等原子的参数,但是模拟效果往往不乐观。Heinz团队开发出...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
290
关于范德华力的一些知识
范德华力的定义是十分模糊的,以至于不同领域给出的答案可能有很大出入,我们国内教材上所说的范德华力大致都是这么说的:“范德华力是一种分...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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