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GROMACS中MDP模板以及关键字讲解
一般来说,gromacs所用到的参数控制文件(mdp)基本上是大同小异的。仅需进行一些小小的更改即可。或者按照自己的体系进行微调。下面给大家提...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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Gromacs联用GAFF力场处理水溶剂下小分子动力学
与GROMACS偏重生物大分子模拟的力场不同,AMBER支持很多方便处理有机小分子的力场,如GAFF力场,简单而又有不错的精度,适合处理有机小分子;...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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水结冰模拟及TIP4PICE水模型使用
以下文章来源于网络,如有侵权,请联系管理员删除!本教程内容适用于Gromacs,包括:1.TIP4P/ICE水模型导入方法;2.冰水建模;转换TIP3P(SPC/E)...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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Gromacs结合自由能计算教程(三)
以下文章来源于网络,如有侵权,请联系管理员删除!一、准备拓扑文件对于一个有一定经验的分子模拟工作者而言,应该知道如何准备拓扑文件。如果...
刘十三613
分子动力学、GROMACS
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Particleworks案例15-水流冲击水池产生气泡过程
本教程演示了如何模拟通过水流冲击水池产生气泡。1、创建新项目1.在工具栏中,单击CreateProject2.在CreateProject窗口,在Projectname命名为...
CFD饭圈
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Particleworks案例16-固体流体相互作用产生气泡过程
本教程演示了如何模拟固体-流体碰撞产生的气泡。1、创建新项目1.在工具栏中,单击CreateProject.2.在CreateProject窗口,在Projectname中输入...
CFD饭圈
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【教程】11-ParaView将航天雷达地形数据进行可视化处理
SRTM数据是通过在航天飞机上搭载的合成孔径雷达(SAR)技术获取的地表雷达图像。本文将介绍如何使用可视化软件ParaView来可视化SRTM数据。1.获...
CFD饭圈
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【教程】29-ParaView设置色标最大最小值
在可视化软件ParaView中,进行等高线图等的色标操作时,数据中包含的最小值和最大值会被自动设定为色标范围。对于时间序列数据,如果按照默认...
CFD饭圈
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Fluent仿真实例-使用MSMD模型模拟单个锂离子电池的放电行为
本教程将模拟锂离子电池的放电行为。使用NTGK模型。电池是一个14.6Ah的LiMn2O4正极/石墨负极电池。电池单元的几何形状如下图所示。1.准备1.文...
CFD饭圈
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Fluent仿真实例-仿真单个锂离子电池的短路问题
1.外部和内部短路处理您将再次使用之前保存的ntgk.cas.h5案例文件来说明如何在电池仿真中处理外部和内部短路。假设电池同时经历外部和内部短路...
CFD饭圈
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