本文来源:WPGLYGH 微算云平台
写在前面
文献综述是科学家的重要资源。他们提供一个领域的历史背景,同时提供其未来发展的意见。撰写综述可以为自己的研究提供灵感,并进行一些写作练习。但是,很少有科学家受过如何写综述的训练——或者如何构成一篇优秀的综述,甚至选择要使用的合适的软件也是一个复杂的决定。因此,Nature杂志向编辑和工作中的科学家们询问了他们的建议。
各路大神
当我还是一个研究生的时候,综述写作提高了我对我的领域历史的理解。我还了解到领域中尚未解决的挑战。
例如,在写我作为博士生的第一篇评论时,我感到沮丧的是,我们对细胞如何主动感知、如何与用于药物传递的纳米颗粒相互作用和如何适应知之甚少。这一经历促使我去研究如何修饰纳米颗粒的表面特性,以增强生物传感。当我转入博士后研究时,这个问题让我发现细胞膜曲率的作用,这引导了我的论文发表和我目前的研究重点。如果没有写那篇综述,我是不会开始这个领域的。
学生在写第一篇评论时普遍存在的一个问题是过于雄心勃勃。当我写这篇文章的时候,我想象着对生物应用中使用的每一种纳米材料做一个全面的总结。它最终变成了一项庞大的工作,讨论的论文太多,而且没有明确的分类方法。我们最终发表了这项工作,但决定将讨论严格限制在生物传感的纳米颗粒上,而不是覆盖不同的纳米材料在生物学上是如何使用的。
我给学生的建议是,要接受这一点:综述不像教科书,它应该提供一个更集中的讨论,跳过一些主题是可以的,这样你就不会分散读者的注意力。学生们也应该考虑编辑的截止日期,尤其是受邀的评论:确保评论的范围不要太广,以免耽误写作。
一篇好的综述还应该避免使用术语,并为刚接触该领域的人解释基本概念。虽然我的专业是工程师,但我对生物学很感兴趣,我的研究方向是开发纳米材料来操纵细胞膜上的蛋白质,以及纳米材料如何影响衰老和癌症。作为一个“局外人”,我发现对这些生物学话题最有用的综述是那些用通俗易懂的科学语言对我说话的评论。
(芝加哥大学化学系副教授)
(Nature Reviews Physics编辑)
作为一名期刊编辑,我的职责之一就是评估提交评论的提案。最好的建议是及时并且清楚地解释为什么读者应该关注所提议的主题。一篇综述仅仅是对最新文献增长的总结是不够的,最有趣的综述反而提供了关于该领域分歧的讨论。
科学家们经常把他们的主要研究论文的故事围绕在他们的数字上——但是当涉及到评论时,数字往往起次要作用。在我看来,回顾数据比大多数人认为的更重要。我最喜欢的一篇评论式文章提出了这样一个图表:将来自多篇研究论文(其中许多论文直接相互矛盾)的数据汇集在一起。然后用这些图表来确定大趋势,并提出可以解释所有不同结论的基本机制。
综述文章的一个重要作用是介绍研究人员到一个领域。因此,示意图有助于说明所讨论的科学,就像演讲的第一张幻灯片一样。这就是为什么在Nature Reviews Physics,我们有内部插画师来帮助作者。然而,简单是关键,即使没有专业插图画家的支持,研究人员仍然可以使用许多免费的绘画工具来提高他们的综述中图表的价值。
(研究助理教授,韩国科学技术高等研究院)
2018年,在读博士期间,我开始撰写题为《利用微生物细胞和噬菌体进行无机纳米材料的生物合成》的综述。我花了一年的时间写第一稿,因为我在博士研究的同时也在写这篇评论,而且大部分时间是我自己在导师的支持下完成的。又花了一年时间完成同行评审、修订和出版的过程。在此期间,发表了许多新的论文,甚至有竞争性的综述。为了提供最新的和开始的综述,我必须与文献保持同步。以我为例,我使用的是Google Scholar,我设置它每天根据关键词更新相关文献。
在我写综述的过程中,我也学会了更开放地接受批评,以提高我的作品的价值和读者群。最初,我的综述只关注于利用细菌等微生物细胞制造纳米材料,这也是我的博士研究课题。像这样的细菌被称为生物工厂:也就是说,生产生物材料的生物体可以经过修饰来生产有用的材料,例如用于药物输送的磁性纳米颗粒。
然而,当第一份同行评议报告返回时,这三位审稿人都建议将评议范围扩大到另一种生物工厂:噬菌体。这些本质上是感染细菌的病毒,它们也可以制造纳米材料。
这些反馈最终引导我讨论了各种生物工厂(噬菌体、细菌、真菌和微藻)之间的差异及其优缺点。这是一个很好的补充,因为它使综述更全面。
写这篇综述也让我产生了利用纳米修饰微生物生产化学品的想法,我现在还在研究中。
(博士研究生,英国剑桥大学)
就在我们因冠状病毒被封锁之前,我的博士导师和我决定写一篇文献综述,讨论医学成像与基因组学的结合以改善卵巢癌的管理。在我研究这篇综述的时候,我注意到一个趋势,一些论文不断被该领域的其他论文引用。我很清楚,这些论文一定很重要,但作为综合癌症生物学领域的新成员,很难立即找到并阅读所有这些“开创性论文”。
就在那时,我决定编写一个小应用程序来提高文献研究的效率。使用我的代码,用户可以输入一个查询,比如“卵巢癌、计算机断层扫描、放射学”,然后应用程序搜索PubMed等数据库中保存的所有以这些关键词为特征的相关文献。然后代码识别出相关的论文,并创建一个在搜索结果中引用的所有参考文献的引用图表。该软件突出显示与搜索中的其他论文有许多引用关系的论文,因此可以称为重要论文。
我的代码极大地改善了我组织论文的方式,并让我了解了我研究领域的关键出版物和发现。否则,这些东西在该领域需要花费更多的时间和经验。当我在GitHub上分享了我的代码后,我收到了反馈,说对于不习惯编码的研究人员来说,这可能是令人畏惧的。因此,我希望建立一个更友好的网页界面,类似于PubMed或谷歌Scholar,在那里用户可以简单地输入他们的查询来生成引文图表。
文件管理软件&协作工具
文件管理软件
协作写作工具
声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,须保留本网站注明的“来源”,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,请与我们接洽。