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Fluent 并行UDF丨05 消息传递宏

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5月前浏览6701

本文摘要(由AI生成):

本文描述了在并行计算环境中,节点间如何进行数据交换的宏定义及其使用方式。特别关注了EXCHANGE_SVAR_MESSAGE、EXCHANGE_SVAR_MESSAGE_EXT和EXCHANGE_SVAR_FACE_MESSAGE这三个宏,它们分别用于在计算节点间交换cell数据和face数据。其中,前两个宏用于cell数据的交换,而最后一个宏用于face数据的交换。文章详细解释了这些宏的用途、形式和用法,并通过一个示例展示了如何在实际应用中使用这些宏来交换存储变量,如单元压力和温度。最后,文章提到了如何确定存储变量的名称,并强调了从包含变量定义的头文件中查找的重要性。


除了访问网格数据的遍历宏外,并行UDF中还需要考虑计算节点之间的数据通讯,这一般采用数据交换宏来实现。

本文内容来自Fluent UDF手册

1 网格单元及网格面分区ID宏

通常网格单元及网格面都有一个分区ID,其编号从0~n-1,这里n为计算节点的数量。网格单元及网格面的分区ID分别存储在宏C_PARTF_PART中。

C_PART(c,tc) 存储整型的网格单元ID,宏F_PART(c,tc) 存储网格面的整型分区ID。

注意,myid可以与分区ID一起使用,因为外部网格单元的分区ID等同于相邻计算节点的ID。

1.1 网格单元分区ID

对于内部网格单元,其分区ID与计算节点ID相同。对于外部网格单元,其计算节点ID与分区ID不同。例如,在有两个计算节点(0和1)的并行系统中,计算节点node-0的外部单元的分区ID为1,计算节点node-1的外部单元的分区ID为0。

1.2 网格面分区ID

内部网格面(Interior Face)与边界面(Boundary zone face)的分区ID与计算节点ID相同。分区边界面(partition boundary face)的分区ID可以与计算节点的ID相同,也可以与相邻计算节点ID相同,这取决于宏F_PART的值。

一个计算节点的外部单元只有分区边界面,其他的网格面属于相邻的计算节点。因此,根据想要处理UDF的计算节点,可能希望将分区边界的分区作为计算节点(使用Fill_Face_Part_With_Same)或使用不同的ID(使用Fill_Face_Part_With_Different)来填充分区边界面。在使用F_PART宏访问分区ID之前,需要先填充它们。在并行udf中很少需要网格面的分区ID。

2 消息显示宏

通过使用编译器指令(例如#if RP_NODE),可以使用Message在Host或Node节点上显示消息。

示例:

#if RP_NODE
   Message("Total Area Before Summing %f\n",total\_area);
#endif

在本例中,消息将由Node节点发送。(host不会发送。)

Message0是一种特殊形式。Message0只在node-0节点发送消息,在其他计算节点上被忽略,且不需要使用编译器指令。

Message0("Total volume = %f\n",total_volume)

3 消息传递宏

当想要将数据从Host发送到所有的node时,可以使用宏host_to_node宏;当想要从node-0发送数据给host时,可以使用node_to_host宏,这两个宏称之为高级宏(High-lever Macro)。如果想要在计算节点之间传递数据,或者将所有计算节点的数据发送给node-0节点时,无法使用这些高级宏,此时需要利用其它的宏来实现。

需要注意,高级通讯宏被展开为执行许多低级消息传递操作的函数,这些操作将数据作为单个数组从一个处理器发送到其他的处理器,通过宏名称的字符标识SENDRECV可以方便识别这些低级消息传递宏。用于向处理器发送数据的宏具有前缀PRF_CSEND,而用于从其他处理器接收数据的宏具有前缀PRF_CRECV。被发送或接收的数据类型包括:字符型(CHAR)、整数型(INT)、实数型(REAL)及逻辑型(BOOLEAN)。

逻辑布尔变量为TRUE或FALSE,实数型在单精度Fluent版本中为float,双精度版本中为double。消息传递宏在prf.h头文件中定义,包含以下类型:

PRF_CSEND_CHAR(to, buffer, nelem, tag)
PRF_CRECV_CHAR (from, buffer, nelem, tag)
PRF_CSEND_INT(to, buffer, nelem, tag)
PRF_CRECV_INT(from, buffer, nelem, tag)
PRF_CSEND_REAL(to, buffer, nelem, tag)
PRF_CRECV_REAL(from, buffer, nelem, tag)
PRF_CSEND_BOOLEAN(to, buffer, nelem, tag)
PRF_CRECV_BOOLEAN(from, buffer, nelem, tag)

这些消息传递宏都包含4个参数.

对于消息发送宏,参数说明包括:

  • to:数据被发送的目的节点ID
  • buffer:被发送的数组名
  • nelem:数组元素数目
  • tag:用户自定义消息标识,约定在发送消息时使用myid

对于消息接收宏,其参数说明:

  • from:消息来源节点ID
  • buffer:接收的数组名
  • nelem:数组元素的数目
  • tag:发送数据的节点ID,按惯例其与from参数相同

注意,如果要发送或接收的变量在函数中定义为real变量,那么可以使用带有_REAL后缀的宏传递消息。之后编译器再双精度版本中将宏替换为PRF_CSEND_DOUBLE或PRF_CRECV_DOUBLE,在单精度版本中将其替换为PRF_CSEND_FLOAT或PRF_CRECV_FLOAT。

因为消息传递宏是低级宏,所以需要确保在从节点处理器发送消息时,相应的接收宏出现在接收节点处理器中。注意,UDF不能直接使用消息传递宏从计算节点(0以外)发送消息到host节点。它们可以通过计算节点node-0间接地向主机发送消息。例如,如果希望并行UDF将所有计算节点的数据发送到host节点进行后处理,则必须首先将数据从每个计算节点传递到node-0节点,然后从node-0节点传递到host节点。在计算节点向node-0发送消息时,node-0节点必须有一个循环来接收来自N个节点的N条消息。

下面是一个编译型的并行UDF示例,它利用消息传递宏PRF_CSEND和PRF_CRECV。中的注释(*/)。

#include "udf.h"
#define WALLID 3

DEFINE_ON_DEMAND(face_p_list)
{

  #if !RP_HOST /* Host will do nothing in this udf. */
     face_t f;
     Thread *tf;
     Domain *domain;
     real *p_array;
     real x[ND_ND], (*x_array)[ND_ND];

     int n_faces, i, j;

     domain=Get_Domain(1);
/* Each Node will be able to access its part of the domain */

     tf=Lookup_Thread(domain, WALLID); /* Get the thread from the domain */

     /* The number of faces of the thread on nodes 1,2... needs to be sent
     to compute node-0 so it knows the size of the arrays to receive
     from each */


     n_faces=THREAD_N_ELEMENTS_INT(tf);

     /* No need to check for Principal Faces as this UDF
     will be used for boundary zones only */


   if(! I_AM_NODE_ZERO_P) /* Nodes 1,2... send the number of faces */
     {
      PRF_CSEND_INT(node_zero, &n_faces, 1, myid);
     }


      /* Allocating memory for arrays on each node */
      p_array=(real *)malloc(n_faces*sizeof(real));
   x_array=(real (*)[ND_ND])malloc(ND_ND*n_faces*sizeof(real));

   begin_f_loop(f, tf)
      /* Loop over interior faces in the thread, filling p_array
      with face pressure and x_array with centroid  */

     {
        p_array[f] = F_P(f, tf);
        F_CENTROID(x_array[f], f, tf);
     }
   end_f_loop(f, tf)


    /* Send data from node 1,2, ... to node 0 */
    Message0("\nstart\n");

   if(! I_AM_NODE_ZERO_P) /* Only SEND data from nodes 1,2... */
   {
      PRF_CSEND_REAL(node_zero, p_array, n_faces, myid);
      PRF_CSEND_REAL(node_zero, x_array[0], ND_ND*n_faces, myid);
   }

     else

   {/* Node-0 has its own data,
     so list it out first */

    Message0("\n\nList of Pressures...\n");
    for(j=0; j<n_faces; j++)
       /* n_faces is currently node-0 value */
      {
    # if RP_3D
        Message0("%12.4e %12.4e %12.4e %12.4e\n",
        x_array[j][0], x_array[j][1], x_array[j][2], p_array[j]);
    # else /* 2D */
        Message0("%12.4e %12.4e %12.4e\n",
        x_array[j][0], x_array[j][1], p_array[j]);
    # endif
    }
 }


    /* Node-0 must now RECV data from the other nodes and list that too */
   if(I_AM_NODE_ZERO_P)
   {
     compute_node_loop_not_zero(i)

      /* See para.h for definition of this loop */
     {
        PRF_CRECV_INT(i, &n_faces,
1, i);
         /* n_faces now value for node-i */
        /* Reallocate memory for arrays for node-i */
              p_array=(real *)realloc(p_array, n_faces*sizeof(real));
        x_array=(real(*)[ND_ND])realloc(x_array,ND_ND*n_faces*sizeof(real));

        /* Receive data */
        PRF_CRECV_REAL(i, p_array, n_faces, i);
        PRF_CRECV_REAL(i, x_array[
0], ND_ND*n_faces, i);
        for(j=0; j<n_faces; j++)
          {

        # if RP_3D
             Message0("%12.4e %12.4e %12.4e %12.4e\n",x_array[j][0], x_array[j][1], x_array[j][2], p_array[j]);
       # else /* 2D */
             Message0("%12.4e %12.4e %12.4e\n",x_array[j][0], x_array[j][1], p_array[j]);
        # endif
          }
      }
   }


   free(p_array); /* Each array has to be freed before function exit */
   free(x_array);

    #endif /* ! RP_HOST */
}

4 计算节点间数据交换宏

EXCHANGE_SVAR_MESSAGEEXCHANGE_SVAR_MESSAGE_EXTEXCHANGE_SVAR_FACE_MESSAGE可用于在计算节点之间交换存储变量(SV_…)。EXCHANGE_SVAR_MESSAGEEXCHANGE_SVAR_MESSAGE_EXT在计算节点之间交换cell数据,而EXCHANGE_SVAR_FACE_MESSAGE在计算节点之间交换face数据。EXCHANGE_SVAR_MESSAGE用于在常规外部单元上交换数据,EXCHANGE_SVAR_MESSAGE_EXT用于在常规和扩展外部单元上交换数据。

宏形式:

EXCHANGE_SVAR_FACE_MESSAGE(domain, (SV_P, SV_NULL));
EXCHANGE_SVAR_MESSAGE(domain, (SV_P, SV_NULL));
EXCHANGE_SVAR_MESSAGE_EXT(domain, (SV_P, SV_NULL));

EXCHANGE_SVAR_FACE_MESSAGE()在udf中很少用户。用户可以在计算节点之间交换多个存储变量。存储变量名由参数列表中的逗号分隔,列表以SV_NULL结束。例如,EXCHANGE_SVAR_MESSAGE(domain, (SV_P, SV_T, SV_NULL))用于交换单元压力和温度变量。用户可以从包含变量定义语句的头文件中确定存储变量名。例如,假设想要与相邻的计算节点交换cell pressure (C_P),可以查看包含C_P (mc .h)定义的头文件,并确定cell pressure的存储变量为SV_P,此时需要将存储变量传递给exchange宏。


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首次发布时间:2020-08-11
最近编辑:5月前
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