在Windows系统下安装和使用Voronoi生成器Neper

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1 引言

Voronoi单元是UDEC和3DEC内置的一种单元，用于模拟不同尺度的岩石断裂过程。尽管UDEC在V1.5版本(20多年前)就引入了二维Voronoi，但3DEC在V7.0后才引入了三维Voronoi，3DEC V5.2不支持Voronoi，如果要在3DEC V5.2中使用Voronoi，必须通过geometry导入外部软件产生的Voronoi，有这样一个软件Neper可以实现这一点，它是一个开源软件，不过这个软件是在非Windows系统下开发的，不能直接应用于Windows系统。本文描述了如何在Windows下安装和使用Neper，事先说明一下，这是一个非常冗长的操作过程，因为它需要安装许多其它库。

2 Neper简介

Neper是一个用于多晶体(polycrystal)生成和网格划分的软件包。多晶体可以是二维或三维。Neper是围绕四个模块建立的：

(1) 模块-T将多晶体生成为镶嵌体(tessellations.);

(2) 模块-M将多晶体描述为镶嵌体文件;

(3) 模块-S处理来自FEPX的模拟结果;

(4) 模块-V可以生成出版物质量的PNG图像或镶嵌体、网格和模拟结果的VTK文件【ParaView在ADONIS, Plaxis, FLAC3D和3DEC中的应用】。

本文主要使用了(1)和(4)的功能，即首先生成一个镶嵌体文件，然后利用这个文件产生出一个png图像。

3 Neper安装过程

Neper是用C语言和少量C++语言编写的，它可以在任何类Unix系统(包括macOS)上运行。Neper也可以使用Linux的Windows子系统WSL、Ubuntu或类似的解决方案在微软Windows上运行。由于我们主要使用Windows系统，因此决定不使用双系统启动，而是使用Linux的Windows子系统WSL。

3.1 安装WSL

当在Windows系统下安装Docker【试一试本地搭建ChatGPT镜像的神器】的时候，会自动提示升级或安装WSL。

3.2 下载Neper

在Neper网站上下载源代码文件包neper-main.zip，这个压缩包大约24M。解压后放到C:\Users\m内，必须注意目录名称不能使用neper，否则后来编译时会出错。

一般情况下，Windows系统下的文件与Linux系统下的文件是不能互相访问的，必须把这些文件放在Linux系统下，使用WSL的好处是可以在Linux系统下访问Windows系统下的文件。

3.3 安装G++编译器

当安装WSL时，并没有默认安装G++编译器，因此需要安装。使用下面的命令：

sudo apt-get updatesudo apt-get install g++g++ --versionwhich g++

第一行更新软件包，第二行安装g++, 安装完成后用第三行检查版本号：

g++ (Ubuntu 11.3.0-1ubuntu1~22.04.1) 11.3.0

第四行检查GNU C++编译器的路径(/usr/bin/g++)。

3.4 安装GSL库

编译Neper需要GSL(GNU Scientific Library)库，因此在编译前必须安装：

sudo apt-get updatesudo apt-get install libgsl-devgsl-config --version

最后一行命令用来检查GSL的版本号(2.7.1)。

3.5 安装Scotch和NLopt

编译Neper需要Scotch和NLopt库。Scotch是一个用于图形和网格划分的软件包，而NLopt是一个用于非线性优化的库。

sudo apt-get updatesudo apt-get install libscotch-dev libnlopt-dev

3.6 编译Neper

在安装完成上述软件包之后，便可以开始编译Neper啦。

cd srcmkdir buildcd buildcmake /mnt/c/Users/m/neperwu/srcmake -jsudo make install

首先进入src目录，建立一个新的子目录build，接着进入到build目录，使用CMake编译，需要注意的是make -j命令，-j的含义是使用多线程编译，如果不使用-j，单线程编译花费的时间会很长。

3.7 测试Neper

编译完成后，对这个软件包进行测试：

sudo apt install cmake-curses-guiccmake ..make test

测试结果显示共有460个模块，其中91%通过了测试，43项没有通过测试。没有通过测试的为-M模块和-V模块。-M模块主要功能为划分网格，需要安装GMsh软件包，而-V模块需要安装POV-Ray软件包。

3.8 检查Neper

使用下面三行命令检查Neper的安装完整性：

(1) neper --help

(2) neper --version

4.6.1-3

(3) neper --license

3.9 安装POV-Ray

POV-Ray用于输出png图像，安装命令如下：

sudo apt-get updatesudo apt-get install povray

4 试验

下面的命令用来创建一个包含100个块体的镶嵌体：

neper -T -n 100

这个命令在build文件夹内生成文件n100-id1.tess。接着使用命令

neper -V n100-id1.tess -print img1

输出名为img1.png的图像。产生另一个镶嵌体，文件名为n100-id2.tess：

neper -T -n 100 -id 2

可视化输出名为img1b的png图像：

  neper -V n100-id2.tess -print img1b

来源：计算岩土力学

断裂非线性 FLAC3D 3DEC 试验 ParaView

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首次发布时间：2023-05-29