VMD 中的原子选择方法
VMD提供了非常丰富的原子选择方法,可以实现非常复杂的原子选择问题。但语法上基本上是 keyword+逻辑运算+通配符+数学表达式,上面keyword是前提,逻辑操作,通配符,和数学表达式要在适当的keyword下进行操作。
Keyword 分别为三类,bool, str,num(布尔型,字符型,数值型),三种类型可以通过逻辑运算,实现复杂的选择。
4. 注意事项:
a) 利用 and, not, or时最好采用 () 进行优先级的处理,以免误解;and时,最好范围小的放在前面。
b) range类型的选择,注意数字比较和字符串比较的区别。
c)上面单引号,双引号及其正则表达式介绍的方法中,在represation窗口下,可以不加单引号和双引号,如果用mol modselect, atomselect命令选择的时候,需要使用并加上{ } 大括号。