Pymol2.3安装方法

pymol是一个很流行的三维蛋白结构显示工具。那么如何安装它的免费版本呢？下面为大家总结了教程。

第一步：下载Anaconda

新手建议选择Python 3.6 Version，（如果你电脑中还有需使用Pyhon 2.7的软件，建议选用Python 2.7 Version，后续设置环境变量。）

 https://www.anaconda.com/download/

第二步：安装Anaconda

建议新手在选项页面打钩。

（熟悉环境变量设置的朋友可以不用勾选，安装完后手动设置会更好。）

安装过程需要较长时间，请耐心等待。

第三步：下载Pymol

第四步：安装Pymol

首先在下载了pymol2.3.0a0-cp36-cp36m-win_amd64.whl的文件夹中，按住Shift键点击鼠标右键，点选“在此处打开Powershell窗口（S）”。

当然也可以使用Anaconda Prompt终端

其次，在命令行输入“pip install pmw”。

然后在命令行输入“pip install pymol-2.3.0a0-cp36-cp36m-win_amd64.whl”。

最后，进入Anaconda的安装目录，找到Anaconda3\Scripts文件夹，里面有pymol.exe执行文件，做一个快捷方式放桌面吧。

第五步：运行pymol显示一个例子

双击pymol.exe打开程序，可以看到最新的2.3版本正常运行了。

下面是一个例子，PDB ID：2RGU，可以看到新版的pymol在使用ray命令后，背景自动透明，且无水印。

保存为png格式，如下图。