生成DNA的pdb结构文件的方法

1、打开下面链接

http://scfbio-iitd.res.in/software/drugdesign/bdna.jsp#

2、在对话框中输入其序列，之后选择DNA的螺旋：A-DNA为右手螺旋，B-DNA右手螺旋，MD DNA是使用分子动力学优化的结构。然后选择Submit Sequence 。

3、点击下图地方下载文件。会生成自动碱基配对之后的DNA结构。若只想要一条链，直接打开pdb文件，手动删除多余链即可。

4、若不知道具体序列，只想要一个随意的DNA的pdb结构，那么可以使用下面网页随机建立指定长度的DNA序列。

http://www.detaibio.com/sms2/random_dna.html