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二氧化硅-石墨烯-氧化石墨烯等周期性体系的构建方法上线！

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GROMACS专题八：二氧化硅-石墨烯-氧化石墨烯等周期性体系的构建方法正式上线！

对于周期性很强的一些有机分子、无机矿物等的模拟，其分子的itp文件是不易从已有工具获得的。可以使用GROMACS自带的功能建模，本课程主要内容如下：

1）石墨烯建模——获得结构以及其itp文件（Amber力场为例）

2）碳纳米管建模——获得结构以及其itp文件（OPLS-AA力场为例）

3）氧化石墨烯建模——获得结构以及其itp文件

4）二氧化硅建模——获得结构以及其itp文件

5）修饰二氧化硅建模——获得结构以及其itp文件

通过以上内容，可以获得做出几乎所有的周期性分子的ITP文件的技能。同样可以创建BN, SiC, CNT, SiN, PNT等材料的拓扑文件。

END

来源：模拟之家

著作权归作者所有，欢迎分享，未经许可，不得转载

首次发布时间：2024-08-28

最近编辑：16天前

博士分子动力学、GROMACS

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GROMACS分子模拟专题八：二氧化硅-石墨烯-氧化石墨烯等周期性体系的构建方法

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