GROMACS是一个开源、自由、免费的分子动力学模拟和能量最小化的计算引擎,广泛用于研究分子的运动和相互作用。它基于牛顿力学和经典物理学原理,通过数值积分来模拟粒子的运动。GROMACS使用基于网格的方法进行模拟,将模拟系统划分为许多小体积的网格单元,每个网格单元内的原子被视为一个质点,并通过相互作用势能进行相互作用。
2024年8月29日20时,仿真秀优秀讲师刘十三613老师,将针对GROMACS分子动力学模拟常见问题进行第一期直播答疑。帮助学习者更快,更加高效的学GROMACS软件和应用。感兴趣的朋友可分享到朋友圈和收藏。
一、答疑嘉宾介绍
刘十三 北京大学博士后 仿真秀优秀讲师,资深分子模拟专家,拥有丰富的分子模拟专业知识和科学研究经验,长期从事该领域重大项目研究,具有深厚的技术底蕴和专业背景
二、答疑范围
1. **软件安装与配置**:
2. **基本操作指导**:
3. **设置GROMACS参数**:
4. **GROMACS力场和拓扑文件**:
5. **模拟结果分析**:
6. **常见问题解决**:
7. **编程和脚本编写**:
8. **实验设计和方法论**:
9. **可视化软件作图指导**
三、用户得到
GROMACS是用于研究生物、化学、物理等学科中分子微观机理的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。它的模拟程序包含GROMACS力场、AMBER力场等诸多力场,研究的范围可以包括玻璃和液晶、聚合物、晶体、界面体系和生物分子溶液(蛋白质、核苷酸、糖等)。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。
专业答疑:刘老师坐镇,为您的每一个疑问提供详尽解答。
现场互动:不仅可以提前提交问题,还有机会现场连线,与专家面对面交流。
问题准备:每位参与者可以准备2-3个问题,进行答疑。
四、适听人群
1、理工学学子和高校教师;
2、化学、生物、物理科研工作者
3、分子动力学模拟兴趣爱好者和应用者
4、GROMACS仿真软件用户和兴趣爱好者
五、如何报名
扫码加入直播,支持反复回看,还加入GROMACS分子模拟技术交流群