课程目标:进一步了解GROMACS相关知识
适用人群:在分子动力学模拟方面零基础、想进一步提升自己的模拟技术
GROMACS是用于研究生物、化学、物理等学科中分子微观机理的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。
它的模拟程序包含GROMACS力场、AMBER力场等诸多力场,研究的范围可以包括玻璃和液晶、聚合物、晶体、界面体系和生物分子溶液(蛋白质、核苷酸、糖等)。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。
该课程拟在为从事上诉科研领域人员提供GROMACS软件专业培训,提高相关人员的技术水平。
无论您前期是否接触过此软件,均可通过此次培训更加熟练的运用本领域的计算仿真。
该课程通过由易到难的知识讲解,让您对GROMACS软件使用有一个全面系统的学习,更好的补充您在自学中忽略的知识内容。
GROMACS是一个开源、自由、免费的分子动力学模拟和能量最小化的计算引擎,广泛用于研究分子的运动和相互作用。它基于牛顿力学和经典物理学原理,通过数值积分来模拟粒子的运动。GROMACS使用基于网格的方法进行模拟,将模拟系统划分为许多小体积的网格单元,每个网格单元内的原子被视为一个质点,并通过相互作用势能进行相互作用。
2024年7月20日20时,仿真秀2024知识周第四期专家报告将邀请北京大学博士后刘十三613老师做《分子动力学原理及其应用—以GROMACS为例》感兴趣的朋友可分享到朋友圈和收藏。
一、嘉宾介绍
刘十三 北京大学博士后 仿真秀优秀讲师
资深分子模拟专家,拥有丰富的分子模拟专业知识和科学研究经验,长期从事该领域重大项目研究,具有深厚的技术底蕴和专业背景
二、授课内容
1、分子动力学原理与应用场景
2、Gromacs模拟蛋白配体讲解
3、分子动力学模拟仿真答疑
4、互动抽奖活动和答疑